QTL : la région du génome derrière un caractère mesurable
En bref
QTL signifie locus de caractère quantitatif, une région du génome qui contribue à un caractère mesurable variant par degrés. De tels caractères tiennent rarement à un seul gène, mais à plusieurs loci à la fois.
Pourquoi de tels caractères existent
Certaines propriétés sont nettement de type tout ou rien, comme le chémotype grossier au locus B. Beaucoup d’autres sont graduelles : hauteur, rendement, date de floraison, teneur en un terpène donné. Ces caractères continus sont façonnés par plusieurs gènes à faible effet chacun, avec l’influence de l’environnement. Ces loci concernés sont les QTL.
Un QTL n’est pas forcément le gène lui-même, mais un segment du génome étroitement lié au gène en cause. Le nombre de QTL qui façonnent un caractère révèle son architecture génétique : quelques loci à fort effet, ou beaucoup à faible effet.
Comment on trouve les QTL
En cartographie QTL, on croise des parents aux expressions différentes, on mesure le caractère dans la descendance et on cherche par la statistique des marqueurs d’ADN qui vont de pair avec des valeurs hautes ou basses. Là où un marqueur coïncide de façon fiable avec le caractère se trouve un QTL. On situe ainsi sur quels chromosomes siègent les gènes concernés.
Lien avec le cannabis
Chez le cannabis, les teneurs en terpènes et en cannabinoïdes se cartographient comme des QTL sur les chromosomes du noyau, avec un effet additif ou dominant des loci concernés. C’est la raison génétique pour laquelle l’arôme n’est pas l’affaire d’un seul parent : il tient à plusieurs loci du noyau, que les deux parents apportent.